Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf149Q3U2C5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rnf149Q3U2C5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
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