Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Vars2Q3U2A8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vars2Q3U2A8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vars2Q3U2A8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms