Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc174Q3U155 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc174Q3U155 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms