Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rasip1Q3U0S6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasip1Q3U0S6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasip1Q3U0S6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms