Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pip4p1Q3TWL2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pip4p1Q3TWL2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pip4p1Q3TWL2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms