Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbxip1Q3TVI8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pbxip1Q3TVI8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pbxip1Q3TVI8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms