Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTJ4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTJ4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms