Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctdnep1Q3TP92 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1Q3TP92 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms