Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc102aQ3TMW1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms