Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms