Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp39Q3TIX9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp39Q3TIX9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms