Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIV5

Zc3h15, Zinc finger CCCH domain-containing protein 15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h15Q3TIV5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h15Q3TIV5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h15Q3TIV5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h15Q3TIV5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h15Q3TIV5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h15Q3TIV5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h15Q3TIV5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zc3h15Q3TIV5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h15Q3TIV5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h15Q3TIV5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms