Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4aQ3TCH7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4aQ3TCH7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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