Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prr27Q3SYJ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prr27Q3SYJ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms