Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ush2AQ2QI47 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ush2AQ2QI47 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms