Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlrp1aQ2LKU9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nlrp1aQ2LKU9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nlrp1aQ2LKU9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms