Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim71Q1PSW8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim71Q1PSW8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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