Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam171bQ14CH0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam171bQ14CH0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam171bQ14CH0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms