Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ptchd1Q14B62 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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ptchd1Q14B62 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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ptchd1Q14B62 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ptchd1Q14B62 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ptchd1Q14B62 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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