Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5bQ0V8T8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap5bQ0V8T8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms