Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab42Q0PD08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab42Q0PD08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab42Q0PD08 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms