Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrioQ0KL02 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrioQ0KL02 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TrioQ0KL02 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TrioQ0KL02 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrioQ0KL02 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrioQ0KL02 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms