Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn2bQ0KL01 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn2bQ0KL01 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn2bQ0KL01 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms