Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kndc1Q0KK55 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kndc1Q0KK55 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kndc1Q0KK55 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms