Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cass4Q08EC4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cass4Q08EC4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms