Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Runx2Q08775 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Runx2Q08775 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms