Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp2Q08652 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbp2Q08652 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbp2Q08652 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms