Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Calb2Q08331 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calb2Q08331 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms