Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdx4Q07424 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdx4Q07424 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms