Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cntn3Q07409 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn3Q07409 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms