Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox10Q04888 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox10Q04888 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox10Q04888 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms