Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tff2Q03404 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tff2Q03404 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tff2Q03404 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms