Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Thbs2Q03350 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thbs2Q03350 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms