Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb5Q02739 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb5Q02739 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms