Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GscQ02591 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GscQ02591 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GscQ02591 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GscQ02591 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GscQ02591 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GscQ02591 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GscQ02591 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GscQ02591 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GscQ02591 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GscQ02591 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GscQ02591 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GscQ02591 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GscQ02591 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GscQ02591 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GscQ02591 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GscQ02591 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GscQ02591 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GscQ02591 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GscQ02591 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GscQ02591 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GscQ02591 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GscQ02591 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GscQ02591 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GscQ02591 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GscQ02591 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GscQ02591 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GscQ02591 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GscQ02591 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GscQ02591 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GscQ02591 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GscQ02591 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GscQ02591 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GscQ02591 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GscQ02591 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GscQ02591 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GscQ02591 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GscQ02591 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GscQ02591 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GscQ02591 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GscQ02591 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GscQ02591 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GscQ02591 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GscQ02591 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GscQ02591 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GscQ02591 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GscQ02591 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GscQ02591 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GscQ02591 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GscQ02591 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GscQ02591 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GscQ02591 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GscQ02591 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GscQ02591 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms