Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zfp39Q02525 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp39Q02525 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms