Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms