Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdcd1Q02242 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pdcd1Q02242 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms