Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PrkcqQ02111 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkcqQ02111 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkcqQ02111 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms