Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Top2aQ01320 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Top2aQ01320 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Top2aQ01320 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Top2aQ01320 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2aQ01320 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Top2aQ01320 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2aQ01320 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Top2aQ01320 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2aQ01320 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2aQ01320 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Top2aQ01320 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Top2aQ01320 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Top2aQ01320 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Top2aQ01320 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Top2aQ01320 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Top2aQ01320 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Top2aQ01320 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Top2aQ01320 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Top2aQ01320 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Top2aQ01320 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Top2aQ01320 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Top2aQ01320 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2aQ01320 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2aQ01320 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Top2aQ01320 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2aQ01320 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Top2aQ01320 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Top2aQ01320 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Top2aQ01320 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Top2aQ01320 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Top2aQ01320 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Top2aQ01320 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Top2aQ01320 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Top2aQ01320 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2aQ01320 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2aQ01320 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms