Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EgfrQ01279 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EgfrQ01279 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EgfrQ01279 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms