Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmgcrQ01237 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgcrQ01237 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms