Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gabpb1Q00420 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gabpb1Q00420 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabpb1Q00420 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms