Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PgrQ00175 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PgrQ00175 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PgrQ00175 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PgrQ00175 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PgrQ00175 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms