Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cds1P98191 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cds1P98191 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cds1P98191 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cds1P98191 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cds1P98191 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cds1P98191 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms