Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lama4P97927 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama4P97927 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama4P97927 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama4P97927 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama4P97927 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama4P97927 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama4P97927 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama4P97927 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms