Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IhhP97812 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IhhP97812 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IhhP97812 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IhhP97812 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IhhP97812 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IhhP97812 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IhhP97812 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IhhP97812 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IhhP97812 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IhhP97812 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IhhP97812 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IhhP97812 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IhhP97812 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IhhP97812 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IhhP97812 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IhhP97812 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IhhP97812 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IhhP97812 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IhhP97812 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IhhP97812 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IhhP97812 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IhhP97812 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IhhP97812 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IhhP97812 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IhhP97812 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IhhP97812 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IhhP97812 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IhhP97812 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IhhP97812 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IhhP97812 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IhhP97812 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IhhP97812 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IhhP97812 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IhhP97812 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IhhP97812 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IhhP97812 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IhhP97812 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IhhP97812 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IhhP97812 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IhhP97812 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IhhP97812 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IhhP97812 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IhhP97812 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IhhP97812 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IhhP97812 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IhhP97812 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IhhP97812 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IhhP97812 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IhhP97812 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IhhP97812 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IhhP97812 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IhhP97812 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IhhP97812 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IhhP97812 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IhhP97812 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IhhP97812 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms