Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Psme1P97371 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme1P97371 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Psme1P97371 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme1P97371 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psme1P97371 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme1P97371 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Psme1P97371 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Psme1P97371 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psme1P97371 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme1P97371 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psme1P97371 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Psme1P97371 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms