Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis3P97368 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Meis3P97368 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Meis3P97368 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis3P97368 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms