Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SmsP97355 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SmsP97355 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SmsP97355 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SmsP97355 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SmsP97355 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SmsP97355 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SmsP97355 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SmsP97355 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SmsP97355 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SmsP97355 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SmsP97355 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmsP97355 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SmsP97355 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SmsP97355 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SmsP97355 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SmsP97355 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SmsP97355 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SmsP97355 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SmsP97355 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SmsP97355 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmsP97355 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmsP97355 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmsP97355 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmsP97355 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmsP97355 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmsP97355 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmsP97355 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmsP97355 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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SmsP97355 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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SmsP97355 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SmsP97355 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SmsP97355 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SmsP97355 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SmsP97355 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SmsP97355 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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SmsP97355 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SmsP97355 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmsP97355 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmsP97355 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmsP97355 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmsP97355 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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SmsP97355 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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SmsP97355 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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SmsP97355 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SmsP97355 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SmsP97355 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SmsP97355 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SmsP97355 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SmsP97355 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SmsP97355 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SmsP97355 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SmsP97355 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SmsP97355 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SmsP97355 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SmsP97355 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms